Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBB4BP68371 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBB4BP68371 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms