Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL11P62913 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL11P62913 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL11P62913 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL11P62913 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL11P62913 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL11P62913 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL11P62913 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms