Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL30P62888 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL30P62888 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL30P62888 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPL30P62888 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL30P62888 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL30P62888 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL30P62888 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL30P62888 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL30P62888 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms