Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR2LP62875 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2LP62875 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms