Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPD2P62316 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPD2P62316 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms