Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNRPD1P62314 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms