Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE2HP62256 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBE2HP62256 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms