Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC01547P58512 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms