Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP4P57796 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP4P57796 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP4P57796 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP4P57796 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CABP4P57796 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP4P57796 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP4P57796 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CABP4P57796 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP4P57796 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP4P57796 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP4P57796 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP4P57796 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP4P57796 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CABP4P57796 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP4P57796 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP4P57796 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP4P57796 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP4P57796 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP4P57796 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP4P57796 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP4P57796 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CABP4P57796 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CABP4P57796 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP4P57796 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP4P57796 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP4P57796 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP4P57796 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CABP4P57796 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP4P57796 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP4P57796 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP4P57796 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP4P57796 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP4P57796 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP4P57796 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CABP4P57796 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CABP4P57796 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CABP4P57796 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CABP4P57796 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP4P57796 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP4P57796 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP4P57796 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP4P57796 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP4P57796 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CABP4P57796 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CABP4P57796 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms