Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX16P57768 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX16P57768 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX16P57768 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX16P57768 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX16P57768 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX16P57768 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX16P57768 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX16P57768 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX16P57768 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNX16P57768 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNX16P57768 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNX16P57768 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms