Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP7P55210 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP7P55210 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP7P55210 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP7P55210 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP7P55210 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CASP7P55210 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CASP7P55210 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP7P55210 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP7P55210 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP7P55210 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP7P55210 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP7P55210 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP7P55210 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CASP7P55210 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP7P55210 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP7P55210 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP7P55210 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP7P55210 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP7P55210 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP7P55210 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP7P55210 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP7P55210 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP7P55210 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CASP7P55210 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP7P55210 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP7P55210 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP7P55210 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP7P55210 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP7P55210 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP7P55210 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP7P55210 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP7P55210 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CASP7P55210 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP7P55210 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP7P55210 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP7P55210 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP7P55210 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP7P55210 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP7P55210 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP7P55210 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP7P55210 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP7P55210 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CASP7P55210 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CASP7P55210 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP7P55210 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP7P55210 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP7P55210 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP7P55210 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP7P55210 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CASP7P55210 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP7P55210 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP7P55210 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CASP7P55210 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CASP7P55210 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CASP7P55210 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CASP7P55210 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms