Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HADHBP55084 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HADHBP55084 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHBP55084 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHBP55084 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHBP55084 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHBP55084 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHBP55084 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHBP55084 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHBP55084 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHBP55084 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHBP55084 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HADHBP55084 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHBP55084 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHBP55084 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHBP55084 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHBP55084 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHBP55084 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHBP55084 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHBP55084 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHBP55084 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HADHBP55084 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HADHBP55084 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HADHBP55084 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HADHBP55084 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHBP55084 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HADHBP55084 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms