Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB1P54762 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms