Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MVDP53602 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MVDP53602 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MVDP53602 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MVDP53602 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MVDP53602 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MVDP53602 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MVDP53602 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MVDP53602 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MVDP53602 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MVDP53602 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MVDP53602 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MVDP53602 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MVDP53602 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MVDP53602 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MVDP53602 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MVDP53602 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MVDP53602 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MVDP53602 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MVDP53602 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MVDP53602 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MVDP53602 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MVDP53602 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MVDP53602 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MVDP53602 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MVDP53602 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MVDP53602 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MVDP53602 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MVDP53602 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MVDP53602 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms