Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP1P53367 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP1P53367 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms