Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDST2P52849 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDST2P52849 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDST2P52849 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDST2P52849 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDST2P52849 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDST2P52849 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDST2P52849 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST2P52849 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST2P52849 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST2P52849 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST2P52849 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST2P52849 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST2P52849 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST2P52849 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST2P52849 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST2P52849 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST2P52849 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms