Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EFNA3P52797 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EFNA3P52797 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms