Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF135P52742 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF135P52742 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF135P52742 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF135P52742 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF135P52742 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF135P52742 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF135P52742 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF135P52742 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF135P52742 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF135P52742 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF135P52742 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF135P52742 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF135P52742 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF135P52742 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF135P52742 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF135P52742 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms