Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRCA2P51587 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA2P51587 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA2P51587 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms