Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAPOLAP51003 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAPOLAP51003 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms