Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBP50607 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBP50607 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBP50607 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBP50607 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBP50607 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBP50607 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBP50607 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBP50607 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBP50607 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBP50607 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBP50607 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBP50607 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBP50607 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUBP50607 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBP50607 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBP50607 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBP50607 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBP50607 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBP50607 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBP50607 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBP50607 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBP50607 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBP50607 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBP50607 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBP50607 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBP50607 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBP50607 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBP50607 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms