Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSRP3P50461 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRP3P50461 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms