Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATMP50440 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATMP50440 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GATMP50440 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATMP50440 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATMP50440 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATMP50440 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATMP50440 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATMP50440 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATMP50440 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATMP50440 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATMP50440 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATMP50440 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATMP50440 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATMP50440 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATMP50440 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATMP50440 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATMP50440 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GATMP50440 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATMP50440 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATMP50440 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GATMP50440 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATMP50440 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATMP50440 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GATMP50440 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATMP50440 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATMP50440 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATMP50440 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATMP50440 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATMP50440 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATMP50440 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATMP50440 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATMP50440 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATMP50440 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATMP50440 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATMP50440 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATMP50440 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATMP50440 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATMP50440 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATMP50440 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATMP50440 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATMP50440 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GATMP50440 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATMP50440 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GATMP50440 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATMP50440 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATMP50440 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms