Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIG4P49917 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIG4P49917 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIG4P49917 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIG4P49917 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIG4P49917 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIG4P49917 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG4P49917 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG4P49917 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG4P49917 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG4P49917 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG4P49917 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG4P49917 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIG4P49917 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms