Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRIM1P49642 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIM1P49642 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRIM1P49642 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms