Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
POLD2P49005 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD2P49005 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD2P49005 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD2P49005 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD2P49005 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD2P49005 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD2P49005 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLD2P49005 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLD2P49005 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLD2P49005 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLD2P49005 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLD2P49005 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD2P49005 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD2P49005 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD2P49005 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD2P49005 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD2P49005 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD2P49005 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD2P49005 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD2P49005 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLD2P49005 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD2P49005 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD2P49005 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD2P49005 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD2P49005 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD2P49005 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD2P49005 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD2P49005 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLD2P49005 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLD2P49005 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLD2P49005 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLD2P49005 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLD2P49005 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLD2P49005 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms