Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PIP4K2AP48426 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PIP4K2AP48426 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PIP4K2AP48426 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms