Protein–RNA interactions for Protein: P46992

YJL171C, Cell wall protein YJL171C, yeastyeast

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL171CP46992 NIS1YNL078W 1224 nt7.26□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 RPS11BYBR048W 471 nt7.26□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 SEC24YIL109C 2781 nt7.26□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 PRB1YEL060C 1908 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 PRS2YER099C 957 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 HEM2YGL040C 1029 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 MTR3YGR158C 753 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YIL054WYIL054W 318 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YLR112WYLR112W 420 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YBL096CYBL096C 309 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YOR366WYOR366W 354 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 ATP3YBR039W 936 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 UTP4YDR324C 2331 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 SRV2YNL138W 1581 nt7.25□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 GNT1YOR320C 1476 nt7.24□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YGR035CYGR035C 351 nt7.24□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 PRP45YAL032C 1140 nt7.24□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 MCR1YKL150W 909 nt7.24□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 VPS52YDR484W 1926 nt7.24□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 MNS1YJR131W 1650 nt7.24□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 MAL33YBR297W 1407 nt7.24□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 HMLALPHA1YCL066W 528 nt7.23□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 MATALPHA1YCR040W 528 nt7.23□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YER137W-AYER137W-A 306 nt7.23□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt7.23□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 COF1YLL050C 432 nt7.23□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 PAC1YOR269W 1485 nt7.23□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 RCK1YGL158W 1539 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 SPO1YNL012W 1896 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YPD1YDL235C 504 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YGL262WYGL262W 528 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 LRP1YHR081W 555 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 YMR326CYMR326C 309 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 RPS3YNL178W 723 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 BRX1YOL077C 876 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 RRD2YPL152W 1077 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 MET30YIL046W 1923 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 RSC30YHR056C 2652 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 ECM27YJR106W 2178 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 ICL1YER065C 1674 nt7.22□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 PRR2YDL214C 2100 nt7.21□□□□□ -1.25
YJL171CP46992 DAD1YDR016C 285 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 VPS61YDR136C 573 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 MIG2YGL209W 1149 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 DJP1YIR004W 1299 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 MTC2YKL098W 1074 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 RNH203YLR154C 333 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 MRPS12YNR036C 462 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 NUT2YPR168W 474 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 RAD28YDR030C 1521 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YLL066CYLL066C 3618 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YLL067CYLL067C 3618 nt7.21□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YFL040WYFL040W 1623 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 HCM1YCR065W 1695 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YDR544CYDR544C 429 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YER076W-AYER076W-A 348 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 ECL1YGR146C 636 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 MEH1YKR007W 555 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YLR031WYLR031W 561 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YPL039WYPL039W 951 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 NUP84YDL116W 2181 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 CNE1YAL058W 1509 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 RIX7YLL034C 2514 nt7.2□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 MOT2YER068W 1764 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YET3YDL072C 612 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 DFM1YDR411C 1026 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YER134CYER134C 537 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YAP5YIR018W 738 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YJL135WYJL135W 318 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 TOD6YBL054W 1578 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 PRC1YMR297W 1599 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 MSN4YKL062W 1893 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 PEX29YDR479C 1665 nt7.19□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YCR013CYCR013C 648 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 snR82snR82 268 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 RRP45YDR280W 918 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YER145C-AYER145C-A 438 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 RME1YGR044C 903 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 GPP1YIL053W 753 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YSF3YNL138W-A 258 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 CUE5YOR042W 1236 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 FSH3YOR280C 801 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 TAF12YDR145W 1620 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 MUP3YHL036W 1641 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 EMP46YLR080W 1335 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 AMD2YDR242W 1650 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 SIS2YKR072C 1689 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 CCC2YDR270W 3015 nt7.18□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 YHR202WYHR202W 1809 nt7.17□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 MET3YJR010W 1536 nt7.17□□□□□ -1.26
YJL171CP46992 UBP16YPL072W 1500 nt7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms