Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NR4A2P43354 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NR4A2P43354 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms