Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GDF5P43026 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GDF5P43026 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GDF5P43026 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GDF5P43026 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF5P43026 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF5P43026 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF5P43026 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF5P43026 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF5P43026 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF5P43026 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF5P43026 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GDF5P43026 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDF5P43026 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GDF5P43026 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF5P43026 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF5P43026 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF5P43026 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF5P43026 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF5P43026 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF5P43026 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF5P43026 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF5P43026 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF5P43026 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GDF5P43026 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF5P43026 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF5P43026 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF5P43026 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF5P43026 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF5P43026 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF5P43026 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF5P43026 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF5P43026 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GDF5P43026 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms