Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPL35P42766 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL35P42766 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL35P42766 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL35P42766 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL35P42766 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL35P42766 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL35P42766 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL35P42766 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL35P42766 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL35P42766 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL35P42766 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms