Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP2P42575 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP2P42575 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CASP2P42575 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CASP2P42575 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CASP2P42575 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASP2P42575 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASP2P42575 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms