Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPHP41219 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPHP41219 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPHP41219 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPHP41219 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPHP41219 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPHP41219 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPHP41219 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPHP41219 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPHP41219 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPHP41219 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPHP41219 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPHP41219 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPHP41219 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPHP41219 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPHP41219 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPHP41219 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPHP41219 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPHP41219 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPHP41219 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPHP41219 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPHP41219 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms