Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYH11P35749 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYH11P35749 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYH11P35749 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYH11P35749 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYH11P35749 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MYH11P35749 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYH11P35749 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYH11P35749 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYH11P35749 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYH11P35749 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYH11P35749 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYH11P35749 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYH11P35749 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYH11P35749 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYH11P35749 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MYH11P35749 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYH11P35749 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYH11P35749 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYH11P35749 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYH11P35749 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYH11P35749 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYH11P35749 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYH11P35749 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH11P35749 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH11P35749 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH11P35749 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH11P35749 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH11P35749 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH11P35749 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH11P35749 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH11P35749 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYH11P35749 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH11P35749 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH11P35749 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH11P35749 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH11P35749 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH11P35749 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH11P35749 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH11P35749 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH11P35749 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH11P35749 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYH11P35749 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYH11P35749 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYH11P35749 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms