Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RFC4P35249 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RFC4P35249 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFC4P35249 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RFC4P35249 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFC4P35249 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RFC4P35249 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFC4P35249 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RFC4P35249 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RFC4P35249 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFC4P35249 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFC4P35249 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RFC4P35249 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFC4P35249 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RFC4P35249 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RFC4P35249 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFC4P35249 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFC4P35249 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RFC4P35249 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFC4P35249 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RFC4P35249 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RFC4P35249 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFC4P35249 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RFC4P35249 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFC4P35249 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFC4P35249 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFC4P35249 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RFC4P35249 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RFC4P35249 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFC4P35249 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
RFC4P35249 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RFC4P35249 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFC4P35249 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RFC4P35249 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFC4P35249 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFC4P35249 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFC4P35249 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFC4P35249 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFC4P35249 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFC4P35249 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFC4P35249 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFC4P35249 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFC4P35249 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFC4P35249 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFC4P35249 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFC4P35249 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFC4P35249 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFC4P35249 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFC4P35249 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RFC4P35249 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFC4P35249 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFC4P35249 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFC4P35249 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RFC4P35249 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RFC4P35249 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC4P35249 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC4P35249 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC4P35249 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC4P35249 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC4P35249 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC4P35249 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC4P35249 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC4P35249 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC4P35249 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RFC4P35249 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RFC4P35249 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFC4P35249 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFC4P35249 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFC4P35249 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RFC4P35249 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFC4P35249 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFC4P35249 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFC4P35249 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFC4P35249 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFC4P35249 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RFC4P35249 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC4P35249 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC4P35249 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC4P35249 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RFC4P35249 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms