Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DSG3P32926 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DSG3P32926 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DSG3P32926 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSG3P32926 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSG3P32926 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DSG3P32926 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG3P32926 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG3P32926 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG3P32926 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG3P32926 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG3P32926 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG3P32926 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG3P32926 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG3P32926 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG3P32926 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DSG3P32926 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DSG3P32926 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG3P32926 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG3P32926 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG3P32926 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG3P32926 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG3P32926 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG3P32926 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG3P32926 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG3P32926 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DSG3P32926 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
DSG3P32926 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DSG3P32926 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG3P32926 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG3P32926 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DSG3P32926 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG3P32926 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG3P32926 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DSG3P32926 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DSG3P32926 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG3P32926 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DSG3P32926 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms