Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCR5P32302 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXCR5P32302 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms