Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A4P31645 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A4P31645 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms