Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA11P31270 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXA11P31270 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms