Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPIFP30405 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPIFP30405 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPIFP30405 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPIFP30405 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPIFP30405 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPIFP30405 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPIFP30405 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPIFP30405 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPIFP30405 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPIFP30405 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPIFP30405 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPIFP30405 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPIFP30405 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPIFP30405 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPIFP30405 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPIFP30405 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPIFP30405 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPIFP30405 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPIFP30405 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms