Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBL1P28749 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBL1P28749 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBL1P28749 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBL1P28749 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBL1P28749 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBL1P28749 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBL1P28749 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBL1P28749 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBL1P28749 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBL1P28749 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBL1P28749 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBL1P28749 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBL1P28749 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBL1P28749 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBL1P28749 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBL1P28749 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBL1P28749 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBL1P28749 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBL1P28749 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBL1P28749 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBL1P28749 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RBL1P28749 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms