Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSFA2P28290 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms