Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HTR2AP28223 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HTR2AP28223 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms