Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSMB5P28074 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PSMB5P28074 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms