Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PSMB9P28065 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PSMB9P28065 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms