Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR2AP24928 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2AP24928 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms