Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPREP23469 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPREP23469 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPREP23469 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPREP23469 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPREP23469 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPREP23469 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPREP23469 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPREP23469 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPREP23469 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPREP23469 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPREP23469 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPREP23469 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPREP23469 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPREP23469 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPREP23469 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPREP23469 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPREP23469 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPREP23469 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPREP23469 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPREP23469 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPREP23469 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPREP23469 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPREP23469 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPREP23469 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPREP23469 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPREP23469 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPREP23469 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPREP23469 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPREP23469 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPREP23469 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPREP23469 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms