Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GLDCP23378 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLDCP23378 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLDCP23378 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLDCP23378 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLDCP23378 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLDCP23378 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLDCP23378 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GLDCP23378 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GLDCP23378 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GLDCP23378 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLDCP23378 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLDCP23378 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLDCP23378 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLDCP23378 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLDCP23378 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLDCP23378 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLDCP23378 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLDCP23378 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLDCP23378 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GLDCP23378 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLDCP23378 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLDCP23378 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms