Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTGS1P23219 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTGS1P23219 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGS1P23219 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGS1P23219 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTGS1P23219 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms