Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XPAP23025 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPAP23025 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
XPAP23025 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPAP23025 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPAP23025 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPAP23025 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPAP23025 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPAP23025 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPAP23025 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPAP23025 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XPAP23025 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPAP23025 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPAP23025 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPAP23025 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPAP23025 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
XPAP23025 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPAP23025 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPAP23025 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPAP23025 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPAP23025 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
XPAP23025 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPAP23025 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
XPAP23025 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPAP23025 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPAP23025 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XPAP23025 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPAP23025 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPAP23025 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPAP23025 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPAP23025 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPAP23025 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPAP23025 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XPAP23025 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPAP23025 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPAP23025 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPAP23025 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPAP23025 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPAP23025 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPAP23025 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPAP23025 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPAP23025 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPAP23025 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPAP23025 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPAP23025 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPAP23025 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPAP23025 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
XPAP23025 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
XPAP23025 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPAP23025 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPAP23025 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPAP23025 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPAP23025 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPAP23025 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPAP23025 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPAP23025 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPAP23025 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPAP23025 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms